بررسی تنوع ژنتیکی گاوماهی شنی (Neogobius fluviatilis) در سواحل استان گلستان با استفاده از نشانگرهای مولکولی ریزماهواره

نوع مقاله : مقاله کامل علمی - پژوهشی

نویسندگان

1 دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

2 nhka;ni adghj , lpdx cdsj

3 دانشیار

4 عضو هیات علمی

چکیده

در این مطالعه ساختار ژنتیک جمعیت گاوماهی شنی (Neogobius fluviatilis) دریای خزر با استفاده از روش میکروستلایت مورد بررسی قرار گرفت.بدین منظور تعداد ۹٠ نمونه از مناطق تالاب گمیشان، گرگان رود و خلیج گرگان واقع در استان گلستان جمع آوری شد. DNA ژنومی با استفاده از روش فنل-کلروفرم استخراج گردید. واکنش زنجیره پلیمراز (PCR) با استفاده از هفت جفت آغازگر میکروستلایت صورت گرفت و محصول آن روی ژل پلی اکریل آمید ٨ درصد الکتروفورز و سپس با نیترات نقره رنگ آمیزی شد. تمام جایگاه‌های مورد استفاده چند شکلی نشان دادند. نتایج نشان داد که گاوماهی شنی از غنای اللی (میانگین تعداد الل:۴٧۶/١٠) و هتروزایگوسیتی مناسبی (میانگین هتروزایگوسیتی مشاهده شده: ٧١۴/٠) در مناطق مورد بررسی برخوردار است. از ۲١ تست جایگاه ژنی-جمعیت، تنها ١ تست در تعادل هاردی-وینبرگ قرار داشت. میزان Fst به عنوان شاخص‌ تمایز ژنتیکی‌ ٠٣٣/٠ بدست آمد. در این خصوص جریان ژنی نسبتا بالای مشاهده شده (۴۹١/۴:Nm) را می‌توان به-عنوان عامل مهمی در تمایز ژنتیکی پایین بدست آمده بین نمونه‌های مناطق مورد بررسی در نظر گرفت. جریان ژنی مشاهده شده می‌تواند با عواملی همچون آلودگی‌ها، سیلاب‌ها و تاریخچه زندگی گاوماهی شنی مرتبط باشد. نتایج آنالیز واریانس مولکولی نیز نشان داد که بخش عمده تنوع مشاهده شده مربوط به درون جمعیت‌ها می‌باشد. بالاترین میزان شباهت بین نمونه‌های مناطق خلیج گرگان با گرگان رود مشاهده شد.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


عنوان مقاله [English]

Genetic diversity of round goby (Neogobius fluviatilis) of the coast of Golestan province using microsatellite molecular markers

نویسندگان [English]

  • shiva sheikh 1
  • Ali Shabany 2
  • Roghayeh Safari 3
  • Hadis kashiri 4
1 gorgan university of agriculture sciences and natural resources
2 Department Of Fisheries
3 Associate Prof
4 department of fisheries
چکیده [English]

In this study, the genetic structure of the Monkey goby population (Neogobius fluviatilis) of the Caspian Sea was investigated using microsatellite method. For this purpose, 90 samples were collected from Gomishan wetland, Gorgan River and Gorgan Bay in Golestan province. Genomic DNA was extracted using phenol-chloroform method. Polymerase chain reaction (PCR) was performed using seven pairs of microsatellite primers and the product was electrophoresed on 8% polyacrylamide gel and then stained with silver nitrate. All applied loci showed polymorphism. The results showed that Monkey goby has proper allelic diversity (mean number of alleles: 2.466) and heterozygosity (average heterozygosity observed: 0.44) in the studied areas. Of the 21 loci-population locus tests, only 1 were in the Hardy-Weinberg equilibrium. Fst value as an indicator of genetic differentiation was 2.5. In this regard, the relatively high gene flow (Nm:4.491) could be considered as an important factor in the low genetic differentiation between the samples of the studied area. The observed gene flow is probably related to factors such as contamination, floods, and the species life history. The results of molecular analysis of variance also showed that most of the observed diversity is within populations. The highest similarity was observed between the samples of Gorgan River and Gorgan Bay.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Genetic diversity
  • Neogobius fluviatilis
  • Molecular marker
  • Microsatellite
  • Golestan province